Valdant kunigaikščiui Kristupui Radvilai Perkūnui (1547-1603m.) Biržuose pradėta statyti pirmoji Lietuvoje bastioninė itališko tipo tvirtovė. 1575 m. buvo užtvenktos per Biržus tekančios Agluonos ir Apaščios upės. Taip Lietuvoje atsirado pirmas dirbtinis tvenkinys, vadinamas Širvėnos ežeru, užliejantys 400 ha plotą.
Tvirtovė pradėta statyti 1586 ir baigta 1589 metais. Buvo skirta karyboms reikalams. Stačiakampį pilies kiemą dengė aukštas pylimas ir vandens griovys. Kiemo kampuose buvo įrengti mūriniai kazematai, gynybinis bokštas, evangelikų reformatų bažnyčia, arsenalas. XVII a. II-oje pusėje pilis buvo restauruota pagal magistro Ulricho ir architekto T. Spinovskio projektą. Šiaurės karo metu 1704 m. švedai užpuolė Biržų pilį ir ją susprogdino. 1978–1988 m. pagal architekto E. Purlio projektą buvo atstatyti rūmai, kuriuose šiuo metu veikia muziejus Biržų krašto muziejus „Sėla“, Biržų m. viešoji biblioteka, savivaldybės posėdžių salė.
Visą pilies kompleksą sudaro atstatytieji rūmai, tiltas, dvi parakinės, vartų bei gynybinių statinių liekanos.
Muziejaus 25 salėse esanti ekspozicija pasakoja apie krašto istoriją ir kultūrą. Tai sėlių ir žiemgalių archeologija, kunigaikščių Radvilų ir grafų Tiškevičių epocha, Biržų kraštas Rusijos imperijos valdymo, Nepriklausomos Lietuvos ir XX a. II pusės laikotarpiu. Daug dėmesio skirta Biržų krašto religinių konfesijų istorijai, raštijai ir menui, etnokultūrinei praeičiai. Kas 3-4 savaites rengiamos ir keičiamos dviejuose muziejaus salėse meno ir dailės kūrinių parodos. Muziejuje lankytojai gali pamatyti vienintelę Lietuvoje atstatytą autentišką XVII a. pab. koklinę krosnį. Taip pat aplankyti unikalią ekspoziciją „Alaus kelias“, bei sudalyvauti programoje „Žaldoko alus“. Čia supažindinama su senosios aludarystės reikmenimis ir aukštaičių vaišingumą menančiomis tradicijomis.
